A Escola de Projetos do CEIVAP foi implantada em 2016, visando à capacitação de estudantes e profissionais da área ambiental para que estes atuassem no acompanhamento e desenvolvimento de ações e atividades técnicas previstas no Plano de Aplicação Plurianual (PAP 2017 - 2020) do CEIVAP. Atualmente, os estagiários da Escola de Projetos trabalham na elaboração de projetos e planos nos municípios inseridos na Bacia do Rio Paraíba do Sul com foco em recursos hídricos. 

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São exemplos dos trabalhos desenvolvidos pelos estagiários da Escola de Projetos: Planos Municipais de Saneamento Básico (PMSB), Projetos de Pagamento por Serviços Ambientais (PSA) com foco em Recursos Hídricos e Planos Municipais de Gestão Integrada de Resíduos Sólidos (PMGIRS). 

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Algumas universidades colaboram, através de apoio técnico para a elaboração dos projetos e planos da Escola de Projetos. São elas:

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• Universidade Estadual Paulista (UNESP)

• Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) - Campus Macaé/RJ

• Universidade de São Paulo (USP) - Campus Lorena/SP

• Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)

• Universidade Federal de Itajubá (UNIFEI)